摘要:近期,Seth Herzon課題組完成了修正后的(-)-lomaiviticin A結(jié)構(gòu)的單體合成,從而在進(jìn)一步佐證結(jié)構(gòu)修訂的同時,發(fā)展了合成(-)-lomaiviticin A所需的糖基化、重氮化及骨架構(gòu)建等關(guān)鍵反應(yīng)
2001年,Wyeth Pharmaceuticals和猶他大學(xué)的研究者通過生物活性指導(dǎo)手段分離細(xì)菌代謝物(-)-lomaiviticin A。(-)-lomaiviticin A的細(xì)胞毒性極高,對多種癌癥細(xì)胞系的半抑制濃度(IC50)低至mM級別?;诤舜殴舱窈透叻直媛寿|(zhì)譜,以及通過與已知天然產(chǎn)物kinamycin的結(jié)構(gòu)進(jìn)行對比,研究者將(-)-lomaiviticin A的結(jié)構(gòu)鑒定為1。該分子結(jié)構(gòu)具有C2對稱性,包含兩個重氮四氫苯并[b]芴基團(tuán)(diazofluorene)和四個2,6-雙脫氧糖基團(tuán)。研究表明(-)-lomaiviticin A獨(dú)特的二聚體結(jié)構(gòu)以及重氮基團(tuán)可以誘導(dǎo)產(chǎn)生細(xì)胞毒性極高的DNA雙鏈斷裂(DNA DSBs)。獨(dú)特的活性作用機(jī)理和復(fù)雜的分子結(jié)構(gòu)使得包括K.C Nicolaou、Matthew D. Shair 和Seth B. Herzon在內(nèi)的許多課題組都將(-)-lomaiviticin A長期作為合成研究的目標(biāo)分子。盡管如此,研究者們在長達(dá)二十年的時間里仍未能完成任何lomaiviticin家族天然產(chǎn)物的全合成。而由于同樣沒有晶體結(jié)構(gòu)的支持,lomaiviticin的結(jié)構(gòu)鑒定事實(shí)上始終未能得到驗(yàn)證。2021年,Hosea M. Nelson課題組(加州理工大學(xué))和Seth B. Herzon課題組(耶魯大學(xué))使用先進(jìn)的高場核磁共振技術(shù)和微晶電子衍射(microED)手段,結(jié)合密度泛函理論計(jì)算(DFT)對(-)-lomaiviticin A的結(jié)構(gòu)進(jìn)行了了修正(2,圖1)。近期,Seth Herzon課題組完成了修正后的(-)-lomaiviticin A結(jié)構(gòu)的單體合成,從而在進(jìn)一步佐證結(jié)構(gòu)修訂的同時,發(fā)展了合成(-)-lomaiviticin A所需的糖基化、重氮化及骨架構(gòu)建等關(guān)鍵反應(yīng)。相關(guān)成果發(fā)表在J. Am. Chem. Soc.上。
逆合成分析和合成路線
對3的逆合成分析最終指向了合成重氮四氫苯并[b]芴的兩個片段:保護(hù)的萘酚衍生物7和環(huán)己烯酮6,以及糖基化給體17和23(圖1)。萘酚片段7的合成首先由已知化合物8經(jīng)氫化鋁鋰還原得到一級醇9,再經(jīng)溴化后經(jīng)過氧化去芳香化在酚羥基對位引入甲氧基得到酚11。11經(jīng)甲基保護(hù)后又經(jīng)一步Appel反應(yīng)得到二溴化物片段7(圖2)。對于兩個糖基化給體17和23,已知的鼠李烯糖衍生物13經(jīng)PMB保護(hù)和加成水兩步反應(yīng)得到還原糖15,再經(jīng)酯化反應(yīng)得到糖基鄰炔基苯甲酸酯給體17。已知的巖藻烯糖衍生物18經(jīng)手性翻轉(zhuǎn)的疊氮取代反應(yīng)產(chǎn)生烯糖20,再經(jīng)乙酸加成和溴化反應(yīng)得到糖基溴化物給體23。已知的二醇24經(jīng)過IBX氧化和TMS保護(hù)得到最后一個片段環(huán)己烯酮6(圖3)。環(huán)己烯酮6在KHMDS攫氫后同二溴化物7發(fā)生α-烷基化反應(yīng)得到化合物25。25在還原性自由基環(huán)化反應(yīng)的條件下關(guān)環(huán)形成重氮四氫苯并[b]芴中五元環(huán)的結(jié)構(gòu)并完成四環(huán)環(huán)系的構(gòu)建,再經(jīng)TBAF脫除硅保護(hù)基得到二醇5。作者通過兩種不同的條件將二醇5轉(zhuǎn)化為硒化物26,用于后續(xù)的糖基化反應(yīng)。
β-糖L-pyrrolosamine的片段由Koenigs-Knorr糖基化反應(yīng)引入。硒化物26與糖基溴化物23在硅酸銀和4 ?分子篩的條件下反應(yīng),反應(yīng)溫度由?50°C逐漸升溫至?20°C,進(jìn)而高選擇性的實(shí)現(xiàn)了β-糖基化(β:α = 15:1)。糖基化產(chǎn)物經(jīng)苯硒基的氧化消除得到烯酮4。作者使用對甲苯磺酰疊氮對化合物4進(jìn)行重氮轉(zhuǎn)移反應(yīng),得到重氮?dú)浠刘?strong style="margin: 0px; padding: 0px; outline: 0px; max-width: 100%; box-sizing: border-box !important; overflow-wrap: break-word !important;">27。由于其不穩(wěn)定,立即對其使用硝酸鈰銨進(jìn)行氧化脫保護(hù)得到重氮萘醌28。經(jīng)過一系列條件篩選,作者最終選擇了PPh3AuOTf催化的俞氏糖基化反應(yīng),實(shí)現(xiàn)了高選擇性的α-糖基化(α:β > 20:1)并合成了全部片段鏈接完成的分子29。29先經(jīng)DDQ脫除糖片段的PMB保護(hù),再經(jīng)Staudinger反應(yīng)和還原胺化在β-糖片段中引入二甲胺基團(tuán)得到31。最后,作者使用乙醚溴化鎂脫除酚羥基的芐基保護(hù),完成了lomaiviticin A單體3的合成。作者將單體3的核磁碳譜同(-)-lomaiviticin A進(jìn)行了比較。除(-)-lomaiviticin A中橋連兩個單體的2號碳外,其余的化學(xué)位移均方根誤差僅為1.68 ppm。這一結(jié)果驗(yàn)證了結(jié)構(gòu)修訂的正確性。作者還以(-)-lomaiviticin A作為陽性對照對于合成的單體3進(jìn)行了細(xì)胞毒性測試。對于測試的四種癌癥細(xì)胞系,(-)-lomaiviticin A都具備nM級別的細(xì)胞毒性,而單體3則在<1 μM的濃度下不具備細(xì)胞毒性。這一結(jié)果進(jìn)一步說明了(-)-lomaiviticin A的二聚體結(jié)構(gòu)對于其細(xì)胞毒性起著決定性的作用。綜上,來自耶魯大學(xué)Seth B. Herzon課題組的研究人員們繼2021年完成lomaiviticin家族天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)修訂后,又于近期又完成了lomaiviticin A單體的全合成。該路線使用了高效的片段連接方法和高立體選擇性的糖基化反應(yīng),為最終實(shí)現(xiàn)(-)-lomaiviticin A的全合成打下了基礎(chǔ)。本文的共同第一作者是課題組四年級博士生徐植和四年級博士生Mikaela DiBello。二年級博士生王澤淳,John A. Rose博士、陳磊博士和李昕博士均對本課題做出了貢獻(xiàn)。
Stereocontrolled Synthesis of the Fully Glycosylated Monomeric Unit of Lomaiviticin AZhi Xu, Mikaela DiBello, Zechun Wang, John A. Rose, Lei Chen, Xin Li, Seth B. HerzonJ. Am. Chem. Soc., 2022, DOI: 10.1021/jacs.2c07631
本文的通訊作者Seth B. Herzon是耶魯大學(xué)化學(xué)系Milton Harris ’29 Ph.D. 教授,耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院藥理與放射醫(yī)學(xué)教授,耶魯癌癥研究中心成員。Herzon課題組致力于復(fù)雜天然產(chǎn)物的全合成研究。課題組在對于lomaiviticin家族天然產(chǎn)物,抗生素pleuromutilin及其衍生物,和腸道菌群基因毒素colibactin進(jìn)行系統(tǒng)研究的同時,也在近年來完成了euonyminol, myrocin G, batzelladine B等多個復(fù)雜天然產(chǎn)物的全合成以及糖基化,烯烴官能化等有機(jī)方法學(xué)的發(fā)展研究。課題組重點(diǎn)關(guān)注天然產(chǎn)物分子或藥物分子的細(xì)胞毒性,通過與生物和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究者的廣泛合作,為闡明細(xì)胞毒性天然產(chǎn)物lomaiviticin和colibactin的作用機(jī)理做出了重要貢獻(xiàn),并在近期發(fā)展了一類針對腦癌的高特異性靶向抗癌分子。